高家堰景区有一段很长的石工墙，主体部分是明代万历年间最初修筑的原始石工墙（后来不断增高）。万历八年（1580年）三月，工科给事中尹瑾阅视河工后，上书说：“高家堰近已筑塞成堤，体制高厚，既有桩板以护其处，复设官府以严其防……终不若包砌石堤，可一劳而永逸也。”此奏疏与潘季驯观点相同。当时潘季驯第三次出任总理河道已经两年，在奏疏得到批准后，遂于十月开工。石工是从原土坝“列字号”起（《千字文》常被用于河工的计程，“列”字排第15号）至“水字号”止，中间共用30个字，一个字为100丈，共计3000丈。高家堰的石工在万历之后，尤其是康熙、雍正、乾隆年间又不断加固并向两头伸长。到乾隆十六年（1751年），终于形成北起马头镇石工头、南至蒋坝镇石工尾，以石工墙来迎水护坡的水上长城——洪泽湖大堤。

沧桑巨变，岁月如梭。咸丰五年，黄河北徙，洪泽湖水面南退几十里，高家堰段石工墙西侧湖区就已成为新滩湖之地。新滩开垦，厂区和庄户林立，此处石工墙不再有防洪功能，但因处于东西道路的两侧和二河渡口的关键位置，堤上原有关帝庙和一些住户（住户外墙以石工墙为根基），此处石工墙的原貌得以保持。而其他石工墙都早在五六十年前就被拆毁了，大量的石块、铁锭，及其垫底的木桩都成了水利工程和民居的建筑材料。

2011年，《高家堰段石工墙露出庐山真面目》的报道（作者为潘新），透露出重要信息：“淮安市文物局聘请中国文化遗产研究院，对……高家堰段石工墙进行局部考古勘探，揭开了千年古堰的神秘面纱。”“经测量，高家堰段石工墙遗存长约800米，全部由条石垒砌，气势雄伟。条石长1米左右、厚约0.4米。据当地居民反映，该段石工墙共有18层，但露出地面的石工墙，多的有7层，少的只有5层……18层的石工墙终于呈现在世人面前。经测量，18层的石工墙高约7米，其中5层暴露在地面以上，13层被湮没在地面以下。经过这次发掘，掌握了高家堰石工墙的详细信息，对于今后开展保护、展示和利用具有重要意义。”